Nhân Chứng Giê-hô-va trải qua sự ngược đãi dữ dội nhất ở Eritrea. Chính phủ Eritrea liên tục bỏ tù, tra tấn và quấy rối Nhân Chứng Giê-hô-va kể từ khi trở thành quốc gia độc lập vào năm 1993. Vào ngày 25-10-1994, tổng thống ban hành một sắc lệnh tuyên bố Nhân Chứng ở Eritrea “bị thu hồi quyền công dân Eritrea” vì từ chối nhập ngũ hoặc không tham gia các hoạt động chính trị. Hậu quả là chính phủ đã tước những quyền dân sự cơ bản của Nhân Chứng.

Sự ngược đãi và khó khăn trong nhiều năm đã khiến nhiều Nhân Chứng chạy sang nước khác. Những người ở lại luôn đứng trước nguy cơ bị ngược đãi và phải rất thận trọng khi tham gia các hoạt động thờ phượng. Qua nhiều năm, chính quyền Eritrea đã bắt và bỏ tù nhiều Nhân Chứng. Một số bị bắt và bỏ tù do từ chối nhập ngũ vì cớ lương tâm; số khác thì do tham dự các buổi nhóm họp tôn giáo, nói với người khác về Kinh Thánh hoặc vì những lý do không được tiết lộ. Trong số những người bị bỏ tù cũng có người nam lớn tuổi, phụ nữ và đôi khi có cả trẻ em. Ba nam Nhân Chứng đã phải ngồi tù hơn 20 năm. Không ai trong đó chính thức bị buộc tội hay bị xét xử và kết án.

Việc Nhân Chứng Giê-hô-va bị ngược đãi ở Eritrea thu hút sự chú ý của quốc tế. Viên chức chính phủ ở châu Phi, châu Âu và Hoa Kỳ đã nêu vấn đề với viên chức Eritrea, nhưng chính quyền Eritrea hầu như không làm gì để giải quyết vấn đề. Nhân Chứng cũng nhiều lần xin được nói chuyện với viên chức Eritrea ở Asmara để giải quyết vấn đề nhưng họ từ chối.